GLnexus
Scalable datastore for population genome sequencing, with on-demand joint genotyping
Main Page
Classes
Files
Class List
Class Index
Class Hierarchy
Class Members
All
Functions
Variables
a
b
c
d
g
i
n
o
r
s
w
All
Classes
Functions
Variables
- a -
all_samples_sampleset() :
GLnexus::BCFKeyValueData
,
GLnexus::Metadata
,
GLnexus::MetadataCache
- b -
begin_writes() :
GLnexus::KeyValue::DB
- c -
collection() :
GLnexus::KeyValue::DB
,
GLnexus::RocksKeyValue::DB
commit() :
GLnexus::KeyValue::WriteBatch
,
GLnexus::RocksKeyValue::WriteBatch
contigs() :
GLnexus::BCFKeyValueData
,
GLnexus::Metadata
,
GLnexus::MetadataCache
create_collection() :
GLnexus::KeyValue::DB
,
GLnexus::RocksKeyValue::DB
current() :
GLnexus::KeyValue::DB
- d -
dataset_header() :
GLnexus::BCFData
,
GLnexus::BCFKeyValueData
dataset_range() :
GLnexus::BCFData
,
GLnexus::BCFKeyValueData
dataset_range_and_header() :
GLnexus::BCFData
discover_alleles() :
GLnexus::Service
- g -
genotype_sites() :
GLnexus::Service
get() :
GLnexus::KeyValue::DB
,
GLnexus::KeyValue::Reader
,
GLnexus::RocksKeyValue::DB
,
GLnexus::RocksKeyValue::Reader
- i -
import_gvcf() :
GLnexus::BCFKeyValueData
InitializeDB() :
GLnexus::BCFKeyValueData
iterator() :
GLnexus::KeyValue::DB
,
GLnexus::KeyValue::Reader
- n -
next() :
GLnexus::RangeBCFIterator
- o -
Open() :
GLnexus::BCFKeyValueData
,
GLnexus::BCFScanner
,
GLnexus::BCFWriter
operator<() :
GLnexus::allele
operator==() :
GLnexus::allele
- r -
range() :
GLnexus::range
read_header() :
GLnexus::BCFScanner
- s -
sample_count() :
GLnexus::BCFKeyValueData
,
GLnexus::Metadata
,
GLnexus::MetadataCache
sample_dataset() :
GLnexus::BCFKeyValueData
,
GLnexus::Metadata
,
GLnexus::MetadataCache
sampleset_range() :
GLnexus::BCFData
,
GLnexus::BCFKeyValueData
sampleset_samples() :
GLnexus::BCFKeyValueData
,
GLnexus::Metadata
,
GLnexus::MetadataCache
Status() :
GLnexus::Status
- w -
write_header() :
GLnexus::BCFWriter
Generated by
1.8.7