|
GLnexus
Scalable datastore for population genome sequencing, with on-demand joint genotyping
|
| BucketExtent (GLnexus) |
| StatsRangeQuery (GLnexus) |
| |||
| Status (GLnexus) | ||||||
| ActiveMetadata (GLnexus) | Metadata (GLnexus) |
| genotyper_config (GLnexus) | ||||
| AlleleDepthHelper (GLnexus) | DB (GLnexus::RocksKeyValue) | MetadataCache (GLnexus) |
| ||||
| DB (GLnexus::KeyValue) |
| WriteBatch (GLnexus::RocksKeyValue) | ||||
| DefaultRangeBCFIteratorImpl (GLnexus) | WriteBatch (GLnexus::KeyValue) | loss_stats (GLnexus) | |||||
| BCFBucketIterator (GLnexus) |
| RangeBCFIterator (GLnexus) |
|
| |||
| BCFBucketRange (GLnexus) | Reader (GLnexus::RocksKeyValue) | ||||||
| BCFData (GLnexus) | Iterator (GLnexus::RocksKeyValue) | Reader (GLnexus::KeyValue) | allele (GLnexus) | minimized_allele_info (GLnexus) | |||
| BCFFileSink (GLnexus) | Iterator (GLnexus::KeyValue) | Residuals (GLnexus) |
|
| |||
| BCFKeyValueData (GLnexus) |
| ResidualsFile (GLnexus) | |||||
| BCFKeyValueData_body (GLnexus) |
| MetadataCache::body (GLnexus) | one_call (GLnexus) | ||||
| BCFScanner (GLnexus) | KStringHash (GLnexus) | Service::body (GLnexus) | LossTracker::orig_call (GLnexus) | ||||
| BCFWriter (GLnexus) |
| Service (GLnexus) |
|
| |||
| LossTracker (GLnexus) | discovered_allele_info (GLnexus) | range (GLnexus) | |||||
1.8.7